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SCI文獻(xiàn)解讀 | 多組學(xué)聯(lián)用方案用途、優(yōu)勢大總結(jié)!南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院IF 9.4文章應(yīng)用思路分享~
多組學(xué)技術(shù)聯(lián)用,近年來幾乎是高分文章,尤其是涉及醫(yī)學(xué)、機(jī)制研究的高分文章比較常見的思路框架了。的確,隨著近幾年多組學(xué)技術(shù)的不斷更新迭代,層出不窮的新技術(shù)不僅豐富了檢測對(duì)象種類,也提高檢測的速度、準(zhǔn)確度、覆蓋度……在此基礎(chǔ)上的多組學(xué)聯(lián)用實(shí)驗(yàn)方案,對(duì)于提高文章的邏輯性、可靠性和完成度都有非常大的幫助。但這也造成了一個(gè)很多科研工作者,尤其是高分文章發(fā)文經(jīng)驗(yàn)不足的研究者常見困惑:這么多種技術(shù),我該選什么?下面,小編就為大家梳理一下幾項(xiàng)常見的多組學(xué)技術(shù)聯(lián)用…
腫瘤微環(huán)境在腫瘤的發(fā)生發(fā)展治療過程中有何影響?
近三十年來,腫瘤治療領(lǐng)域在免疫療法、靶向藥物及聯(lián)合治療方案的推動(dòng)下實(shí)現(xiàn)了突破性進(jìn)展。然而臨床數(shù)據(jù)顯示,超過80%的治療方案難以實(shí)現(xiàn)完全治愈,即使獲得顯著初期療效的病例也常面臨腫瘤復(fù)發(fā)和耐藥性轉(zhuǎn)化的問題。值得注意的是,近年研究證實(shí)腫瘤微環(huán)境(TME)在腫瘤耐藥、免疫逃逸及轉(zhuǎn)移擴(kuò)散等腫瘤進(jìn)展中具有決定性作用。什么是腫瘤微環(huán)境?腫瘤微環(huán)境是由腫瘤細(xì)胞及其周邊基質(zhì)共同構(gòu)成的動(dòng)態(tài)生態(tài)系統(tǒng),包括多種類型的基質(zhì)細(xì)胞(成纖維細(xì)胞、淋巴細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞)、免疫細(xì)…
【國自然熱點(diǎn)推薦】鐵自噬 | 鐵死亡的好兄弟
毋庸置疑,鐵死亡已然成為國自然關(guān)注的大熱點(diǎn)。小編今天另辟蹊徑,帶大家看看鐵死亡的好兄弟“鐵自噬(Ferritinophagy)”有沒有借著大哥的聲望站起來~鐵自噬國自然研究現(xiàn)狀鐵自噬作為國自然研究的新方向,近三年中標(biāo)率不斷攀升。2023年鐵自噬相關(guān)中標(biāo)項(xiàng)目已達(dá)10篇以上,涉及肺纖維化、慢阻肺、復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)、骨關(guān)節(jié)炎、腫瘤、腎損傷和肝損傷等多種疾病類型。玩轉(zhuǎn)國自然的大佬們也緊跟當(dāng)前研究潮流,將鐵自噬和鐵死亡、相分離、免疫等研究熱點(diǎn)進(jìn)行交互機(jī)制研究,屬實(shí)是掌握了國自然的…
細(xì)胞分選寶典:流式分選
流式分選通過不同的熒光素標(biāo)記樣本中一種或多種細(xì)胞,再經(jīng)由流式細(xì)胞儀區(qū)別不同細(xì)胞的光散射和熒光特征,將不同細(xì)胞分離。流式分選的步驟相對(duì)來說比較固定:制備單細(xì)胞懸液;細(xì)胞染色;細(xì)胞分選;后續(xù)細(xì)胞培養(yǎng)、分析。其中比較困難的就是關(guān)于抗體偶聯(lián)熒光素的選擇:比如,已經(jīng)確定好了要分選細(xì)胞的marker,但是偶聯(lián)的熒光素不知道怎么選。一般來說需要遵循三個(gè)原則:01根據(jù)儀器配置選擇熒光素:多色標(biāo)記熒光素搭配時(shí)還應(yīng)當(dāng)每個(gè)通道只選擇一種熒光素;各個(gè)通道之間的熒光素可以互相搭配…
【病理干貨】HE染色法方法介紹及與常見問題分析
蘇木精 — 伊紅染色法 ,簡稱HE染色法 ,石蠟切片技術(shù)里常用的染色法之一 。蘇木精是陽離子染料,能夠?qū)⒓?xì)胞核內(nèi)的嗜堿性物質(zhì)染成藍(lán)紫色。伊紅是陰離子染料,能夠?qū)⒓?xì)胞質(zhì)和膠原纖維等染成粉紅色。HE染色法是組織學(xué)、胚胎學(xué)、病理學(xué)教學(xué)與科研中最基本、使用最廣泛的技術(shù)方法。HE染色法的原理是怎么樣的?●細(xì)胞核染色原理蘇木精為堿性天然染料,可使細(xì)胞核著色。細(xì)胞核內(nèi)染色質(zhì)的成分主要是DNA,在DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)中,兩條核苷酸鏈上的磷酸基向外,使DNA雙螺旋的外側(cè)帶負(fù)電荷,呈酸性…
【國自然熱點(diǎn)推薦】細(xì)胞衰老研究思路 | 關(guān)鍵機(jī)制錦上添花
自Leonard Hayflick提出“細(xì)胞衰老”這一概念,相關(guān)研究逐漸進(jìn)入科研視線?!暗挚顾ダ稀?、“長生不老”更是從兩千多年前延續(xù)至今的話題。那么什么是衰老(Aging),什么又是細(xì)胞衰老(Cellular senescence)呢?二者等同嗎?衰老不利于機(jī)體健康的話,細(xì)胞衰老一定是百害無一利的嗎?接下來由小編為您一一揭秘!走進(jìn)細(xì)胞衰老衰老是生命體生理功能隨時(shí)間推移及環(huán)境變化出現(xiàn)衰退的生理過程,是個(gè)體走向自然死亡的必經(jīng)之路。細(xì)胞衰老則是指細(xì)胞處于一種穩(wěn)定的細(xì)胞周期停滯狀態(tài),是衰老的復(fù)…
超詳細(xì)!動(dòng)物行為學(xué)——Morris水迷宮實(shí)驗(yàn)的影響因素有哪些?
Morris水迷宮(Morriswatermaze)實(shí)驗(yàn)于1981年由英國心理學(xué)家RichardGMorris設(shè)計(jì),最初用于研究大鼠的空間學(xué)習(xí)記憶功能,此后被不斷地完善和改進(jìn),逐漸成為研究學(xué)習(xí)記憶最常用的實(shí)驗(yàn)方法之一。目前Morris水迷宮實(shí)驗(yàn)在國內(nèi)外已得到普遍認(rèn)可,成為應(yīng)用最廣泛的研究和評(píng)價(jià)動(dòng)物空間學(xué)習(xí)記憶能力的經(jīng)典行為學(xué)實(shí)驗(yàn)。影響水迷宮實(shí)驗(yàn)結(jié)果的因素一般涉及幾方面,實(shí)驗(yàn)裝置,實(shí)驗(yàn)環(huán)境,動(dòng)物種類等。實(shí)驗(yàn)裝置Morris水迷宮實(shí)驗(yàn)裝置通常組成部分: 水箱及底部加熱器: 實(shí)驗(yàn)中可將水溫恒定在20-26度對(duì)…
【干貨】HE染色實(shí)驗(yàn)步驟及常見問題解析
HE染色全名為蘇木精(hematoxylin)和伊紅(eosin)染色方法,是最基本的也是最重要的病理學(xué)染色技術(shù)。HE切片是病理醫(yī)生得以做出正確診斷的關(guān)鍵。HE染色是目前國內(nèi)外病理診斷上廣泛采用的 常規(guī)染色方法。切片質(zhì)量的好壞,可直接影響疾病診斷的及時(shí)與準(zhǔn)確性。因此,能制作出一張高質(zhì)量的HE染色切片,是必須掌握的技術(shù)之一。01染色原理1.細(xì)胞核染色原理:蘇木精為堿性天然染料,可使細(xì)胞核著色。細(xì)胞核內(nèi)染色質(zhì)的成分主要是DNA,在DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)中,兩條核苷酸鏈上的磷酸基向外,使DNA雙螺…
獨(dú)家整理:銅死亡檢測方法
21世紀(jì)是生命科學(xué)迅速發(fā)展的世紀(jì)。作為科研人員,不僅要腳踏實(shí)地、心無旁騖,還要“眼觀六路,耳聽八方”,實(shí)時(shí)掌握科研動(dòng)態(tài)。今天小編要說的是銅死亡(Cuproptosis),想必大家對(duì)銅死亡并不陌生,畢竟它的問世,可以說是掀起了學(xué)術(shù)界一片巨浪。但小伙伴們真的了解銅死亡嗎?沒關(guān)系,小編馬上就會(huì)讓你好好熟識(shí)“它”。銅(Cu)是一種重要的膳食微量營養(yǎng)素,包括Cu+(還原型)和Cu2+(氧化型)兩種離子形式參與細(xì)胞生理功能的酶促調(diào)節(jié)。那么Cu是怎么進(jìn)入細(xì)胞發(fā)揮功能的呢?第一步,在進(jìn)…
【國自然熱點(diǎn)推薦】細(xì)胞焦亡|經(jīng)典細(xì)胞死亡方式如何玩出新花樣
細(xì)胞固有一死,其死亡方式可謂絢麗多彩,讓人眼花繚亂。在眾多細(xì)胞死亡方式之中,小編發(fā)現(xiàn),“細(xì)胞焦亡”作為出道20多年的“老演員”,在最近幾年不斷沖擊國自然“熱搜榜單”,實(shí)力不容小覷(圖1)。這是如何做到的呢?今天,就由小編來和大家嘮嘮細(xì)胞焦亡,看看是怎么個(gè)事兒~圖1 細(xì)胞焦亡相關(guān)國自然項(xiàng)目中標(biāo)情況(數(shù)據(jù)來源:ZCOOL國自然科學(xué)基金查詢平臺(tái))老規(guī)矩,讓我們先來回顧一下細(xì)胞焦亡相關(guān)的小知識(shí)~
一文搞定IP、CoIP、CHIP、RIP
實(shí)驗(yàn)名稱雖相撞,看我如何巧分辨。IP、CoIP、CHIP、RIP傻傻分不清?別著急,看完這篇你就懂了,包教包會(huì)!我們先掌握共性部分,再記住區(qū)分要點(diǎn),這樣就可以啦!免疫沉淀(IP)免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是一種研究蛋白質(zhì)間交互作用的生物技術(shù),這種技術(shù)是將蛋白質(zhì)視為抗原,并利用抗體與之進(jìn)行特異性結(jié)合的特性,來進(jìn)行研究。這項(xiàng)技術(shù)可用來將含有上千種不同蛋白質(zhì)的樣品中,分離和濃縮出特定蛋白質(zhì)。進(jìn)行免疫沉淀法時(shí),抗體需要和一個(gè)受質(zhì)結(jié)合。IP的實(shí)驗(yàn)原理很簡單,就和“…
旋轉(zhuǎn)?跳躍?小鼠的異常行為
小鼠刻板行為Stereotypical behavior of mice.小鼠在繁育過程中經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)大量的問題,有些是人為操作不當(dāng),有些則是小鼠自發(fā)性問題,而我們在做實(shí)驗(yàn)的過程中,經(jīng)常會(huì)發(fā)現(xiàn)小鼠會(huì)在籠子里“旋轉(zhuǎn)”“跳躍”,這究竟是由哪些原因?qū)е碌哪??讓我們一起看下去吧。小鼠刻板行為指的是一種固定且重復(fù)的行為模式,通常表現(xiàn)為一些無意義或無目的的動(dòng)作,例如上述提到的,小鼠在同一位置不停地轉(zhuǎn)圈、追趕自己的尾巴,或者是小鼠在籠內(nèi)拐角處不停地原地跳躍,又或者是小鼠不停地在籠內(nèi)上下翻轉(zhuǎn)等等…
如何用流式細(xì)胞術(shù)檢測線粒體膜電位,質(zhì)量以及ROS水平?
線粒體——細(xì)胞的“能量中樞”與“命運(yùn)開關(guān)”在微觀的細(xì)胞世界中,線粒體不僅是制造能量的“發(fā)電廠”(95%的ATP由此產(chǎn)生),更是調(diào)控生死決策的“指揮中心”。當(dāng)線粒體功能健全時(shí),它們通過膜電位(ΔΨm) 驅(qū)動(dòng)ATP合成、鈣穩(wěn)態(tài)與信號(hào)傳導(dǎo);一旦功能崩潰(如凋亡、疾病中),則會(huì)觸發(fā)活性氧(ROS)爆發(fā)與線粒體網(wǎng)絡(luò)解體——這些變化如同細(xì)胞命運(yùn)的“早期警報(bào)”。為什么需要精準(zhǔn)檢測線粒體?1. 功能監(jiān)控(ΔΨm):? 膜電位是線粒體健康的“電壓表”,其崩潰(如JC-1紅綠比↓或TMRE熒光…
重磅綜述!Nature頂級(jí)子刊(IF:113.915)|自噬研究沒有新思路,一文了解
自噬是一個(gè)吞噬自身細(xì)胞質(zhì)蛋白或細(xì)胞器并使其包被進(jìn)入囊泡,并與溶酶體融合形成自噬溶酶體,降解其所包裹的內(nèi)容物的過程,借此實(shí)現(xiàn)細(xì)胞本身的代謝需要和某些細(xì)胞器的更新。今天小編分享一篇發(fā)表在《Nature reviews Molecular cell biology》雜志上的關(guān)于自噬的綜述文章,IF:113.915。摘要維持蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)和細(xì)胞器完整性和功能對(duì)于細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和細(xì)胞活力至關(guān)重要。自噬是介導(dǎo)將各種細(xì)胞貨物運(yùn)送到溶酶體以進(jìn)行降解和回收的主要機(jī)制。大量研究表明自噬對(duì)疾病具有重要的保護(hù)作用。然而,在癌癥…
大(?。┓肿拥鞍譝B如何跑出漂亮條帶?這幾個(gè)步驟一定要優(yōu)化!
Western Blot作為基礎(chǔ)生命科學(xué)檢測方法之一,目前已經(jīng)有適配性較高的通用型實(shí)驗(yàn)檢測方案和流程。但蛋白質(zhì)作為一個(gè)特異性較強(qiáng)的檢測指標(biāo),總會(huì)有一些并不適用于常規(guī)方法,且需要我們對(duì)實(shí)驗(yàn)步驟進(jìn)行優(yōu)化或者修改,才能保證得到較為理想的結(jié)果。如果你研究的蛋白分子量較大或較小,且苦于一直跑不出好看的WB結(jié)果,那么這篇文章一定可以幫到你!WB實(shí)驗(yàn)一般流程什么是大/小分子蛋白1)大分子蛋白大分子蛋白一般指WB檢測中分子量>200kDa的蛋白質(zhì),由于其分子量大,遷移速度慢,轉(zhuǎn)膜困難等特…
疾病動(dòng)物模型-心肌梗死模型
在醫(yī)學(xué)研究中,心肌梗死模型是一種重要工具,能夠幫助科學(xué)家深入理解心肌梗塞的病理生理機(jī)制和治療方法的發(fā)展。通過模擬心肌梗塞的發(fā)生過程,研究人員可以更精確地探索疾病的發(fā)病機(jī)制、評(píng)估治療效果,進(jìn)而推動(dòng)臨床實(shí)踐的進(jìn)步。本文將從心肌梗死的疾病背景出發(fā),詳細(xì)探討其發(fā)病機(jī)制,綜述近年來在動(dòng)物模型方面的研究進(jìn)展,重點(diǎn)介紹小鼠心肌梗死模型的手術(shù)步驟及操作要點(diǎn),并對(duì)模型的表型評(píng)價(jià)方法進(jìn)行詳細(xì)分析,旨在為相關(guān)研究提供參考。心肌梗死疾病背景心肌梗死(myocardial infarctio…
【國自然熱點(diǎn)推薦】巨噬細(xì)胞胞外誘捕網(wǎng)現(xiàn)狀+機(jī)制+實(shí)驗(yàn) | 一文統(tǒng)統(tǒng)搞定!
巨噬細(xì)胞極化、巨噬細(xì)胞鐵死亡、巨噬細(xì)胞代謝重編程、巨噬細(xì)胞吞噬、巨噬細(xì)胞遷移……小編想一定是這些研究熱點(diǎn)的堆積,才一步步把巨噬細(xì)胞送上“國自然榜一”的地位~在這些研究熱點(diǎn)中,有一個(gè)隱藏頗深的熱點(diǎn)可能很多小伙伴們還沒發(fā)現(xiàn),今天小編把它揪出來“公之于眾”,讓更多小伙伴們知道,巨噬細(xì)胞竟還會(huì)“布下天羅地網(wǎng)”!噔~噔~噔~今天的重磅推薦——巨噬細(xì)胞胞外誘捕網(wǎng)(Macrophage Extracellular Traps,METs)來啦!巨噬細(xì)胞胞外誘捕網(wǎng)——研究現(xiàn)狀深知大家時(shí)間寶貴,小編直接…
一文拯救 WB 實(shí)驗(yàn)!Western blot 內(nèi)參選擇避坑全攻略
一、常見的內(nèi)參抗體 1.β-actin(42 kDa)特點(diǎn):β-actin 是細(xì)胞骨架的重要組成部分,廣泛存在于大多數(shù)細(xì)胞和組織中,其表達(dá)相對(duì)穩(wěn)定,且與眾多目標(biāo)蛋白的分子量差異較大,便于在 Western blot 實(shí)驗(yàn)中區(qū)分。局限性:在肌肉組織中,β-actin 的高表達(dá)可能影響內(nèi)參的準(zhǔn)確性。此外,其聚合狀態(tài)易受細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的影響,從而導(dǎo)致表達(dá)水平發(fā)生變化。因此,在肌肉組織相關(guān)研究或涉及細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)中,建議優(yōu)先選擇其他內(nèi)參抗體,如 GAPDH 或 β-tubulin。2.GAPDH(36 kDa)特點(diǎn):GAPDH…
告別玄學(xué)!一文搞懂 PCA 降維原理+ 避坑指南
生物醫(yī)學(xué)研究的浩瀚海洋中,我們常常面臨著海量且高維度的數(shù)據(jù)洪流。以基因數(shù)據(jù)為例,每一個(gè)樣本都承載著成千上萬個(gè)基因的測量指標(biāo),每一個(gè)基因都宛如一個(gè)獨(dú)特的特征維度,共同構(gòu)成了一個(gè)復(fù)雜龐大的多維數(shù)據(jù)空間。然而,人類的認(rèn)知能力在面對(duì)如此高維度的數(shù)據(jù)時(shí),往往顯得力不從心,難以直觀地洞察樣本之間的內(nèi)在差異與聯(lián)系。此時(shí),主成分分析(PCA,principal component analysis)便如同一座明亮的燈塔,為我們在數(shù)據(jù)的迷霧中指引方向。PCA 是一種經(jīng)典的降維方法,其核心理念在于從眾…
細(xì)胞遷移 / 侵襲實(shí)驗(yàn)全攻略
細(xì)胞遷移和侵襲是生物學(xué)研究中常見的現(xiàn)象,也是疾病發(fā)展過程中重要的環(huán)節(jié)。細(xì)胞遷移/侵襲實(shí)驗(yàn)作為一種常用的生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn),旨在評(píng)估細(xì)胞的侵襲和遷移能力,尤其是對(duì)細(xì)胞在模擬體內(nèi)的生理環(huán)境下的行為進(jìn)行模擬和觀察,一般在腫瘤惡性化表型研究中最常見。因?yàn)樵谀[瘤治療中,普遍認(rèn)為抑制腫瘤細(xì)胞遷移和侵襲是有效的治療手段。因此在對(duì)腫瘤細(xì)胞進(jìn)行干預(yù)(過表達(dá)、敲低、敲除、點(diǎn)突變、藥物處理)后對(duì)細(xì)胞的遷移與侵襲能力進(jìn)行檢測,可以作為評(píng)估干預(yù)效果的一個(gè)有效指標(biāo)。No.1細(xì)胞遷移/侵…
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