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科研服務(wù)

代謝組

▼ 服務(wù)介紹

【實驗原理】

代謝組學(xué)實驗的原理是通過定性鑒別和定量描述生物基質(zhì)中小分子代謝物的表達與修飾變化,以系統(tǒng)反饋生命體對自身機體調(diào)控或外界環(huán)境擾動所做出的代謝應(yīng)答。代謝組學(xué)研究的樣本主要包括生物體液和復(fù)雜的生物組織或細(xì)胞樣本。常用的分析鑒定技術(shù)有色譜質(zhì)譜聯(lián)用和核磁共振。

【實驗步驟】

1. 實驗設(shè)計

2. 樣品制備

3. 數(shù)據(jù)采集

4. 數(shù)據(jù)預(yù)處理

5. 多實驗數(shù)據(jù)集成/數(shù)據(jù)分析

【常見問題與注意事項】

取樣基本原則

代表性和一致性

實驗組與對照組樣本在取材部位、時間處理等方面盡可能保持一致,從而保證實驗的可信度;

迅速性

操作過程迅速,最大限度縮短樣本采集到實驗的時間;

低溫原則

所有樣本離體后,分離步驟應(yīng)在4℃或冰上進行,分離好的樣本立即存于-80℃,以免樣本產(chǎn)生進一步代謝活動;

血液樣本收集指南

血清:

1)用促凝管(沒有促凝管則用離心管)收集血液,將促凝管/離心管直立、靜置于試管架上,避免振蕩、摔落;

2)避免陽光直射,室溫;

3)檢查凝血完全后,2500 ~ 3000 rpm,4℃ 低速離心5 min,吸取200 μL上清液至1.5 mL離心管中,若上清液較多可每管200 μL、多管分裝,于-80 ℃凍存待用;

4)嚴(yán)禁反復(fù)凍融,如發(fā)生溶血則該樣本不合格、需重新準(zhǔn)備樣本。合格樣本用干冰運輸。

 

 

血漿:

1)用抗凝管采血,采血后立刻輕柔上下顛倒8次,使抗凝劑與血液均勻混合(動作輕柔,以避免產(chǎn)生溶血);

2)2500 ~ 3000 rpm,4 ℃低速離心5 min,吸取200 μL上清液分裝至1.5mL離心管中,-80 ℃凍存待用;

3)血液樣本采集后應(yīng)立即把血漿從全血中分離出來,最晚不遲于采血后1 h內(nèi)分離出血漿。合格樣本用干冰運輸。

(1)試管的使用

涉及到RNA等的多組學(xué)實驗取樣,請勿使用肝素鈉抗凝管(對 RNA 相關(guān)實驗有嚴(yán)重影響,抑制反轉(zhuǎn)錄酶活性而導(dǎo)致cDNA量不足);

核磁實驗(NMR)請勿使用EDTA抗凝管(影響圖譜采譜);

代謝實驗取樣不建議使用檸檬酸鈉抗凝管(檸檬酸是TCA循環(huán)中的重要物質(zhì),使用檸檬酸鈉抗凝劑會引入外源污染),請根據(jù)實驗具體情況選用合適的抗凝管。

(2)影響因素

取血時如用酒精消毒,請擦干擦拭部位,待酒精完全揮發(fā)后再取樣;

取血時如有使用麻醉劑,建議用異氟醚消毒,以避免在譜圖中出現(xiàn)干擾峰。

(3)產(chǎn)率

血清參考產(chǎn)率:30% ~ 50%(例如:1 mL 全血大約能得 0.3 ~ 0.5 mL 血清)。

血漿參考產(chǎn)率:≈ 50 %(例如:1 mL全血大約能得 0.5 mL 血漿)。

采全血時如使用真空采血管,建議使用促凝管。

(4)凍存管的使用

強烈推薦收集盡量多的樣本并分裝凍存(同批次樣本可以用于多項實驗,且避免反復(fù)凍融而導(dǎo)致結(jié)果不理想),分裝保存時推薦使用1.5 mL離心管,因為螺口凍存管帽內(nèi)有一個密封用的橡膠墊圈,長期在-80 ℃/干冰等低溫下,橡膠圈會變硬脆、易脫落,導(dǎo)致管口密封不嚴(yán),樣本滲露。

【交付標(biāo)準(zhǔn)】

1. 實驗報告 

2. 真實實驗結(jié)果

3. 原始圖片

4. 實驗原始數(shù)據(jù)

5. 剩余物料在周期內(nèi)可返還(超過周期,不予返還)

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