代謝組
▼ 服務(wù)介紹
【實驗原理】
代謝組學(xué)實驗的原理是通過定性鑒別和定量描述生物基質(zhì)中小分子代謝物的表達與修飾變化,以系統(tǒng)反饋生命體對自身機體調(diào)控或外界環(huán)境擾動所做出的代謝應(yīng)答。代謝組學(xué)研究的樣本主要包括生物體液和復(fù)雜的生物組織或細(xì)胞樣本。常用的分析鑒定技術(shù)有色譜質(zhì)譜聯(lián)用和核磁共振。
【實驗步驟】
1. 實驗設(shè)計
2. 樣品制備
3. 數(shù)據(jù)采集
4. 數(shù)據(jù)預(yù)處理
5. 多實驗數(shù)據(jù)集成/數(shù)據(jù)分析
【常見問題與注意事項】
取樣基本原則
代表性和一致性
實驗組與對照組樣本在取材部位、時間處理等方面盡可能保持一致,從而保證實驗的可信度;
迅速性
操作過程迅速,最大限度縮短樣本采集到實驗的時間;
低溫原則
所有樣本離體后,分離步驟應(yīng)在4℃或冰上進行,分離好的樣本立即存于-80℃,以免樣本產(chǎn)生進一步代謝活動;
血液樣本收集指南
血清:
1)用促凝管(沒有促凝管則用離心管)收集血液,將促凝管/離心管直立、靜置于試管架上,避免振蕩、摔落;
2)避免陽光直射,室溫;
3)檢查凝血完全后,2500 ~ 3000 rpm,4℃ 低速離心5 min,吸取200 μL上清液至1.5 mL離心管中,若上清液較多可每管200 μL、多管分裝,于-80 ℃凍存待用;
4)嚴(yán)禁反復(fù)凍融,如發(fā)生溶血則該樣本不合格、需重新準(zhǔn)備樣本。合格樣本用干冰運輸。
血漿:
1)用抗凝管采血,采血后立刻輕柔上下顛倒8次,使抗凝劑與血液均勻混合(動作輕柔,以避免產(chǎn)生溶血);
2)2500 ~ 3000 rpm,4 ℃低速離心5 min,吸取200 μL上清液分裝至1.5mL離心管中,-80 ℃凍存待用;
3)血液樣本采集后應(yīng)立即把血漿從全血中分離出來,最晚不遲于采血后1 h內(nèi)分離出血漿。合格樣本用干冰運輸。
(1)試管的使用
涉及到RNA等的多組學(xué)實驗取樣,請勿使用肝素鈉抗凝管(對 RNA 相關(guān)實驗有嚴(yán)重影響,抑制反轉(zhuǎn)錄酶活性而導(dǎo)致cDNA量不足);
核磁實驗(NMR)請勿使用EDTA抗凝管(影響圖譜采譜);
代謝實驗取樣不建議使用檸檬酸鈉抗凝管(檸檬酸是TCA循環(huán)中的重要物質(zhì),使用檸檬酸鈉抗凝劑會引入外源污染),請根據(jù)實驗具體情況選用合適的抗凝管。
(2)影響因素
取血時如用酒精消毒,請擦干擦拭部位,待酒精完全揮發(fā)后再取樣;
取血時如有使用麻醉劑,建議用異氟醚消毒,以避免在譜圖中出現(xiàn)干擾峰。
(3)產(chǎn)率
血清參考產(chǎn)率:30% ~ 50%(例如:1 mL 全血大約能得 0.3 ~ 0.5 mL 血清)。
血漿參考產(chǎn)率:≈ 50 %(例如:1 mL全血大約能得 0.5 mL 血漿)。
采全血時如使用真空采血管,建議使用促凝管。
(4)凍存管的使用
強烈推薦收集盡量多的樣本并分裝凍存(同批次樣本可以用于多項實驗,且避免反復(fù)凍融而導(dǎo)致結(jié)果不理想),分裝保存時推薦使用1.5 mL離心管,因為螺口凍存管帽內(nèi)有一個密封用的橡膠墊圈,長期在-80 ℃/干冰等低溫下,橡膠圈會變硬脆、易脫落,導(dǎo)致管口密封不嚴(yán),樣本滲露。
【交付標(biāo)準(zhǔn)】
1. 實驗報告
2. 真實實驗結(jié)果
3. 原始圖片
4. 實驗原始數(shù)據(jù)
5. 剩余物料在周期內(nèi)可返還(超過周期,不予返還)
康旭禾生物提供包括動物實驗、細(xì)胞實驗、分子實驗、病理實驗、流式檢測實驗及論文翻譯、潤色、投稿輔助等相關(guān)的各項服務(wù)。
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