一、常見的內(nèi)參抗體
1.β-actin(42 kDa)
特點(diǎn):β-actin 是細(xì)胞骨架的重要組成部分,廣泛存在于大多數(shù)細(xì)胞和組織中,其表達(dá)相對穩(wěn)定,且與眾多目標(biāo)蛋白的分子量差異較大,便于在 Western blot 實(shí)驗(yàn)中區(qū)分。
局限性:在肌肉組織中,β-actin 的高表達(dá)可能影響內(nèi)參的準(zhǔn)確性。此外,其聚合狀態(tài)易受細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的影響,從而導(dǎo)致表達(dá)水平發(fā)生變化。因此,在肌肉組織相關(guān)研究或涉及細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)中,建議優(yōu)先選擇其他內(nèi)參抗體,如 GAPDH 或 β-tubulin。
2.GAPDH(36 kDa)
特點(diǎn):GAPDH 參與糖酵解等代謝過程,其在多數(shù)細(xì)胞和組織中表達(dá)較為穩(wěn)定,且與多數(shù)目標(biāo)蛋白的分子量差異較大,便于在 Western blot 實(shí)驗(yàn)中區(qū)分。此外,GAPDH 的價格適中,是常用的內(nèi)參抗體之一。
局限性:在特定條件下,如缺氧等,GAPDH 的表達(dá)可能會發(fā)生改變。此外,若研究涉及糖代謝相關(guān)領(lǐng)域,GAPDH 的表達(dá)變化可能會影響內(nèi)參的準(zhǔn)確性。在這種情況下,建議選擇 β-actin 作為替代內(nèi)參抗體。
3.β-tubulin(55 kDa)
特點(diǎn):β-tubulin 是細(xì)胞微管結(jié)構(gòu)的重要組成部分,其表達(dá)相對穩(wěn)定,能夠與不同分子量的目標(biāo)蛋白區(qū)分,適用于細(xì)胞骨架相關(guān)研究。
局限性:β-tubulin 的穩(wěn)定性可能受到藥物處理或細(xì)胞生理狀態(tài)的影響。在某些特殊細(xì)胞類型或疾病模型中,其表達(dá)可能不穩(wěn)定。因此,在這些情況下,GAPDH 可能是更好的選擇。
二、如何選擇內(nèi)參抗體
1.目的蛋白分子量大小
在選擇內(nèi)參抗體時,應(yīng)確保目的蛋白與內(nèi)參蛋白的分子量相差至少5 kDa,以避免在Western blot實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)條帶重疊,從而確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可讀性。
2.目的蛋白的細(xì)胞定位
①胞漿和全細(xì)胞蛋白:可選擇β-actin(42 kDa)、GAPDH或β-tubulin。其中,β-actin在胞漿中表達(dá)高效且穩(wěn)定,但理論上在細(xì)胞核內(nèi)不表達(dá),因此不能作為核蛋白的內(nèi)參。
②胞核蛋白:可選擇PCNA(GB12010)、Histone H3(GB11102)等,這些蛋白在細(xì)胞核中表達(dá)穩(wěn)定,適合作為核蛋白的內(nèi)參。
③核膜蛋白:可選擇Lamin B1(GB111802),其在核膜中表達(dá)穩(wěn)定,適合作為核膜蛋白的內(nèi)參。
④線粒體蛋白:可選擇COXIV(GB11250)、VDAC1(GB121939)等,這些蛋白在線粒體中表達(dá)穩(wěn)定,適合作為線粒體蛋白的內(nèi)參。
3.組織特異性
在脂肪組織中,β-actin的表達(dá)量較低,不適合作為內(nèi)參抗體。
在腦組織中,β-tubulin的表達(dá)較高,而β-actin的表達(dá)量可能較低,因此建議選擇β-tubulin作為內(nèi)參。
在骨骼肌、心肌和平滑肌中,β-tubulin的表達(dá)可能發(fā)生變化或特化,而GAPDH的表達(dá)相對穩(wěn)定,因此建議選擇GAPDH作為內(nèi)參。
不同組織和細(xì)胞類型對內(nèi)參蛋白的適用性存在差異。例如:
對于其他來源的樣本,如果研究較少,建議參考相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,選擇合適的內(nèi)參蛋白。
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1. 動物實(shí)驗(yàn)
動物飼養(yǎng)、疾病造模、行為學(xué)檢測、心功能、無創(chuàng)血壓、血常規(guī)、全自動生化檢測等
2. 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
CCK8/MTT、原代細(xì)胞分離、流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞劃痕、侵襲、遷移、EDU染色、轉(zhuǎn)染、穩(wěn)定株
3. 分子生物學(xué)
PCR檢測、熒光定量PCR、絕對定量PCR、端粒酶長度、pull down、雙熒光素酶、SSR、SNP檢測等
4. 蛋白實(shí)驗(yàn)
WB、Co-IP、酵母雙雜
5. 病理實(shí)驗(yàn)
HE染色、免疫組學(xué)、電鏡
6. 生理生化實(shí)驗(yàn)
肝腎功能、抗氧化、免疫反應(yīng)等生理免疫指標(biāo);動植物營養(yǎng)指標(biāo)、微量元素、重金屬、酶活等。
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