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- 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
- 動(dòng)物飼養(yǎng) 疾病造模 行為學(xué)檢測(cè) 心功能 無創(chuàng)血壓 血常規(guī) 全自動(dòng)生化檢測(cè)等
- 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
- CCK8/MTT 原代細(xì)胞分離 流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞劃痕 侵襲 遷移 EDU染色 轉(zhuǎn)染 穩(wěn)定株篩選
細(xì)胞有許多“花樣”死亡方式,比如大家常見的細(xì)胞凋亡、焦亡、鐵死亡等等。
不同細(xì)胞死亡方式的時(shí)間線
(DOI: 10.1038/s12276-023-01078-x)
不同的細(xì)胞死亡方式有其特異的生化特征,形態(tài)特征及調(diào)控路徑等。一起來了解......
01
細(xì)胞凋亡
細(xì)胞凋亡(Apoptosis),又稱細(xì)胞自殺,是細(xì)胞在基因控制下主動(dòng)死亡的過程,這種細(xì)胞死亡方式有助于從組織中移除不必要或有害的細(xì)胞,而不觸發(fā)炎癥反應(yīng)。
細(xì)胞凋亡的特點(diǎn):
◆ 細(xì)胞收縮:細(xì)胞體積縮小,細(xì)胞膜變得更加緊密。
◆ 核凝集和碎裂:細(xì)胞核物質(zhì)凝聚,并最終分裂成較小的片段。
◆ 細(xì)胞膜改變:細(xì)胞膜的組成發(fā)生變化,特別是膜磷脂的外翻,使得細(xì)胞被免疫細(xì)胞識(shí)別并清除。
◆ 細(xì)胞碎片形成:細(xì)胞被切割成多個(gè)包含細(xì)胞器和細(xì)胞核碎片的小體,這些小體被稱為細(xì)胞碎片或凋亡小體。
細(xì)胞凋亡分為外源性凋亡和內(nèi)源性凋亡。
外源性凋亡就是,當(dāng)它細(xì)胞接受到外界通知它死亡的信號(hào)的時(shí)候,它通過一系列復(fù)雜的級(jí)聯(lián)反應(yīng),自己將自己破壞,導(dǎo)致死亡。
內(nèi)源性凋亡就是它感應(yīng)到自身內(nèi)部出現(xiàn)了一些問題的時(shí)候(比如DNA遭到破壞),也可能觸發(fā)它啟動(dòng)它的自殺程序,導(dǎo)致它的死亡。
外源性通路(Extrinsic pathway)通常由細(xì)胞表面的死亡受體與相關(guān)配體(如TNF-α、FasL、TRAIL)引發(fā)結(jié)合引發(fā),進(jìn)而誘導(dǎo)受體激活,導(dǎo)致死亡誘導(dǎo)信號(hào)復(fù)合物(DISC)的形成。該復(fù)合體的成員包括銜接蛋白FADD和TRADD,它們招募和激活caspase-8/caspase-10,然后可以激活下游效應(yīng)器caspase(caspase-3、caspase-7)。激活后的caspase可直接降解細(xì)胞內(nèi)的結(jié)構(gòu)蛋白和功能蛋白,引起凋亡。
內(nèi)源性通路(Intrinsic pathway)主要通過線粒體受損和氧化應(yīng)激反應(yīng)觸發(fā)。這個(gè)過程受到Bcl-2家族中蛋白質(zhì)活性之間平衡的嚴(yán)格調(diào)節(jié)。
當(dāng)具有BH3結(jié)構(gòu)域(如BAD、BID和BIM)的促凋亡家族成員在細(xì)胞應(yīng)激期間通過表達(dá)變化或通過翻譯后修飾被激活時(shí),促凋亡蛋白BAX和BAK誘導(dǎo)線粒體外膜通透性(MOMP)增加,導(dǎo)致細(xì)胞色素C釋放到細(xì)胞質(zhì)中。然后游離細(xì)胞色素C與Apaf-1形成稱為凋亡小體的復(fù)合物,激活caspase-9,進(jìn)而激活caspase-3等執(zhí)行酶,引發(fā)細(xì)胞死亡。
內(nèi)在和外在途徑最終都依賴于半胱天冬酶家族特定成員的蛋白酶活性。
(DOI: 10.1038/s12276-023-01078-x)
02
壞死性凋亡
壞死性凋亡(Necroptosis)是類似于細(xì)胞壞死的一種程序性細(xì)胞死亡形式,當(dāng)細(xì)胞在炎癥、氧化或缺血應(yīng)激后未能正常發(fā)生細(xì)胞凋亡時(shí),細(xì)胞壞死性凋亡就會(huì)作為凋亡的“替補(bǔ)”方式被采用。
不同于凋亡,壞死性凋亡不依賴于caspase活性,但需要RIPK3調(diào)控的MLKL磷酸化。這種磷酸化事件使MLKL在質(zhì)膜上產(chǎn)生孔復(fù)合體,從而導(dǎo)致DAMP的分泌、細(xì)胞腫脹和膜破裂。
大多數(shù)關(guān)于壞死性凋亡分子機(jī)制的研究涉及腫瘤壞死因子(TNF)信號(hào)通路。通常,TNF通過NF-κB信號(hào)傳導(dǎo)激活促炎基因來誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)。
(DOI: 10.1038/s12276-023-01078-x)
03
細(xì)胞焦亡
細(xì)胞焦亡(Pyroptosis)又稱細(xì)胞炎性壞死,是由炎癥小體引發(fā)的一種細(xì)胞程序性死亡,表現(xiàn)為細(xì)胞不斷脹大直至細(xì)胞膜破裂,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)容物釋放進(jìn)而引起強(qiáng)烈的炎癥反應(yīng)。
在存在病原體相關(guān)的分子模式(PAMP)或細(xì)胞衍生的損傷相關(guān)的分子模式(DAMP)的情況下,細(xì)菌、病毒、真菌和原生動(dòng)物的細(xì)胞內(nèi)感染會(huì)激活焦亡。
發(fā)生焦亡的細(xì)胞顯示細(xì)胞腫脹、膜起泡、DNA斷裂和最終細(xì)胞裂解等特征。但是,細(xì)胞核通常保持完整,這與凋亡和壞死性凋亡中觀察到的細(xì)胞核破壞現(xiàn)象不同。
在經(jīng)典途徑中,PAMPs和DAMPs接受細(xì)胞內(nèi)信號(hào)分子刺激并與pro-caspase-1和ASC組裝形成炎癥小體和活性caspase-1。Cleaved-caspase-1裂解GSDMD和pro-IL-1β/18。N-GSDMD通過形成非選擇性孔來穿透細(xì)胞膜,進(jìn)一步導(dǎo)致水流入、裂解和死亡。此外,IL-1β和IL-18是從N-GSDMD形成的孔中分泌出來的。
(DOI: 10.1038/s12276-023-01078-x)
04
鐵死亡
鐵死亡(Ferroptosis)是于2012年首次提出的一種由鐵依賴的氧化損傷引起的非調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡方式,其特征在于線粒體變小、線粒體嵴減少、線粒體膜密度增加和線粒體膜破裂增加。
鐵死亡是由磷脂過氧化作用引起的,這一過程依賴于代謝產(chǎn)物活性氧(ROS)、含有多不飽和脂肪酸鏈(PUFA-PL)的磷脂和過渡金屬鐵,細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞間信號(hào)和環(huán)境壓力可通過調(diào)節(jié)細(xì)胞代謝和ROS水平影響鐵死亡。
(DOI: 10.1038/s12276-023-01078-x)
05
細(xì)胞自噬
自噬(Autophagy)是是指細(xì)胞利用溶酶體降解,選擇性地清除自身受損、衰老或過剩的生物大分子和細(xì)胞器,釋放出游離小分子供細(xì)胞回收利用的正常動(dòng)態(tài)生命過程。
細(xì)胞自噬的過程主要包括隔離膜(Phagophore)的形成、擴(kuò)展、自噬體(Autophagosome)的形成、自噬體與溶酶體融合后形成自噬溶酶體(Autophagolysosome),自噬溶酶體形成后,內(nèi)含物被溶酶體中的水解酶消化。
自噬發(fā)生在四個(gè)階段:誘導(dǎo)、成核、延伸、融合,每個(gè)步驟都有調(diào)節(jié)點(diǎn)。
◆ 自噬誘導(dǎo)階段(Induction):主要通過ATG1/ULK1復(fù)合體介導(dǎo),以及mTORC1的參與。
◆ 前體成核階段(Nucleation):主要由Vps34-Beclin1復(fù)合體介導(dǎo),參與吞噬泡成核;還可召集ATG12-ATG5-ATG16復(fù)合物及LC3,促進(jìn)吞噬泡膜的延伸。
◆ 延伸階段(Elongation):自噬前體形成之后,吞噬泡膜會(huì)繼續(xù)延伸,直至完全包裹內(nèi)容物。自噬體的延伸主要依賴于兩個(gè)類泛素化的系統(tǒng):a)ATG12的結(jié)合過程;b)LC3 的修飾過程。
◆ 自噬體成熟階段:隨著自噬體的擴(kuò)張和封閉,自噬體經(jīng)歷成熟過程,包括清除在自噬體外膜上的ATGs蛋白,招募負(fù)責(zé)溶酶體傳遞的蛋白和介導(dǎo)與溶酶體融合的蛋白。
◆ 自噬體與溶酶體融合階段(Fusion):自噬體與溶酶體融合形成自溶酶體,自噬溶酶體通過水解酶降解其內(nèi)容物,并將剩余物質(zhì)輸出到細(xì)胞質(zhì)中以供再利用。
(DOI: 10.1038/s12276-023-01078-x)
總結(jié)
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主營(yíng)項(xiàng)目
1
動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
動(dòng)物飼養(yǎng)、疾病造模、行為學(xué)檢測(cè)、心功能、無創(chuàng)血壓、血常規(guī)、全自動(dòng)生化檢測(cè)等
2
細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
CCK8/MTT、原代細(xì)胞分離、流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞劃痕、侵襲、遷移、EDU染色、轉(zhuǎn)染、穩(wěn)定株
3
分子生物學(xué)
PCR檢測(cè)、熒光定量PCR、絕對(duì)定量PCR、端粒酶長(zhǎng)度、pull down、雙熒光素酶、SSR、SNP檢測(cè)等
4
蛋白實(shí)驗(yàn)
WB、Co-IP、酵母雙雜
5
病理實(shí)驗(yàn)
HE染色、免疫組學(xué)、電鏡
6
生理生化實(shí)驗(yàn)
肝腎功能、抗氧化、免疫反應(yīng)等生理免疫指標(biāo);動(dòng)植物營(yíng)養(yǎng)指標(biāo)、微量元素、重金屬、酶活等。
7
多組學(xué)實(shí)驗(yàn)
基因組、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、蛋白組、代謝組、微生物多樣性、宏基因組、生信分析
8
整體課題實(shí)驗(yàn)
方案設(shè)計(jì)、整體實(shí)驗(yàn)交付、標(biāo)書寫作、論文潤(rùn)色、協(xié)助投稿
END
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