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- 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
- 動(dòng)物飼養(yǎng) 疾病造模 行為學(xué)檢測(cè) 心功能 無(wú)創(chuàng)血壓 血常規(guī) 全自動(dòng)生化檢測(cè)等
- 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)
- CCK8/MTT 原代細(xì)胞分離 流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞劃痕 侵襲 遷移 EDU染色 轉(zhuǎn)染 穩(wěn)定株篩選
曾經(jīng)叱咤科研界的細(xì)胞死亡,小編也是不止一次為大家分享相關(guān)的熱點(diǎn)思路,但是現(xiàn)在這類文章在生信領(lǐng)域確實(shí)已經(jīng)相對(duì)“泛濫”,想再依靠鐵死亡、自噬、銅死亡等熱點(diǎn)發(fā)篇高分生信文需要在數(shù)據(jù)和分析思路上有足夠的創(chuàng)新性才行。既然這么卷,咱們?yōu)樯斗且粔K湊熱鬧呢?新熱點(diǎn)不是更香嗎?“乳酸化修飾”就是2024年最火的國(guó)自然熱點(diǎn)之一,一出場(chǎng)就是CNS,2025年它的熱度延續(xù),目前Nature各大子刊,例如NC、Cell Research、CDD(Cell Death & Differentiation)等已紛紛發(fā)表了新年的第一篇乳酸化。
第一篇NC
這篇文章于2025年1月8日由南京中醫(yī)藥大學(xué)王南溪、中國(guó)藥科大學(xué)葉慧共同通訊在Nature Communications在線發(fā)表。作者開(kāi)發(fā)了一個(gè)綜合的工作流程,包括通過(guò)蛋白組學(xué)來(lái)識(shí)別乳酸化位點(diǎn),通過(guò)遺傳密碼擴(kuò)增(GCE)來(lái)表達(dá)活細(xì)胞中特定位點(diǎn)的乳酸化蛋白,以及利用綜合功能分析(IFA)平臺(tái)來(lái)評(píng)估其生物學(xué)效應(yīng)。通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)、GCE和生化分析作者研究了ALDOA-K147的乳酸化作用,揭示了其對(duì)細(xì)胞過(guò)程的多種調(diào)控作用,包括代謝、核易位和基因調(diào)控。 這篇文章多組學(xué)(蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等)整合,也再次突出了生信技術(shù)在如今頂刊文章中的重要應(yīng)用價(jià)值!
第二篇Cell Research
這篇文章是1月6號(hào)在線發(fā)表的,由海軍軍醫(yī)大學(xué)/中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院/南開(kāi)大學(xué)曹雪濤團(tuán)隊(duì)聯(lián)合發(fā)表。研究聚焦免疫代謝的異常激活誘導(dǎo)免疫病理的機(jī)制,研究結(jié)果揭示了S-D-乳酰谷胱甘肽(SLG)誘導(dǎo)的非酶D-乳酸化的免疫代謝反饋回路,并暗示糖酵解分支途徑中的乙二醛酶II(GLO2)是對(duì)抗臨床炎癥疾病的有希望的靶點(diǎn)。
第三篇Cell Death & Differentiation
這篇文章(2025年1月3日發(fā)表)由南京醫(yī)科大學(xué)聯(lián)合安徽醫(yī)科大學(xué)聯(lián)合發(fā)表。該研究基于團(tuán)隊(duì)之前的乳酸化蛋白組學(xué)研究,篩選了非組蛋白ABCF1為研究對(duì)象,揭示了非組蛋白ABCF1-K430乳酸化通過(guò)HIF1信號(hào)通路的轉(zhuǎn)錄激活促進(jìn)肝細(xì)胞癌惡性進(jìn)展。
以上幾篇頂刊文章都是以濕實(shí)驗(yàn)為主,生信分析作為輔助,下面小編再帶大家看一篇近期發(fā)表的生信文章。
這項(xiàng)研究基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的AMI(急性心梗)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)集,采用差異表達(dá)分析和WGCNA識(shí)別關(guān)鍵基因。乳酸化相關(guān)基因(LRGs)來(lái)自MSigDB數(shù)據(jù)庫(kù)。將差異基因、WGCNA模塊基因以及LRGs取交集獲得了4個(gè)關(guān)鍵基因。隨后進(jìn)行無(wú)監(jiān)督共識(shí)聚類將AMI進(jìn)行亞型分類,并開(kāi)發(fā)機(jī)器學(xué)習(xí)模型進(jìn)行診斷。最終通過(guò)SD大鼠原代心肌細(xì)胞對(duì)4個(gè)關(guān)鍵基因的表達(dá)水平進(jìn)行驗(yàn)證。
這篇文章99%都是生信分析,分析方法也是咱們常見(jiàn)的,復(fù)現(xiàn)難度比較低。而且該研究最終篩選到了4個(gè)關(guān)鍵基因,后續(xù)還可以鎖定其中之一進(jìn)行深入的機(jī)制研究,一個(gè)不錯(cuò)的課題就出來(lái)了。如果你也對(duì)乳酸化感興趣,想復(fù)現(xiàn)或個(gè)性化定制思路,歡迎直接聯(lián)系,專業(yè)團(tuán)隊(duì)為您量身打造最佳思路,主打一個(gè)讓您滿意!
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主營(yíng)項(xiàng)目
1. 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
動(dòng)物飼養(yǎng)、疾病造模、行為學(xué)檢測(cè)、心功能、無(wú)創(chuàng)血壓、血常規(guī)、全自動(dòng)生化檢測(cè)等
2. 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
CCK8/MTT、原代細(xì)胞分離、流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞劃痕、侵襲、遷移、EDU染色、轉(zhuǎn)染、穩(wěn)定株
3. 分子生物學(xué)
PCR檢測(cè)、熒光定量PCR、絕對(duì)定量PCR、端粒酶長(zhǎng)度、pull down、雙熒光素酶、SSR、SNP檢測(cè)等
4. 蛋白實(shí)驗(yàn)
WB、Co-IP、酵母雙雜
5. 病理實(shí)驗(yàn)
HE染色、免疫組學(xué)、電鏡
6. 生理生化實(shí)驗(yàn)
肝腎功能、抗氧化、免疫反應(yīng)等生理免疫指標(biāo);動(dòng)植物營(yíng)養(yǎng)指標(biāo)、微量元素、重金屬、酶活等。
7. 多組學(xué)實(shí)驗(yàn)
基因組、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、蛋白組、代謝組、微生物多樣性、宏基因組、生信分析
8. 整體課題實(shí)驗(yàn)
方案設(shè)計(jì)、整體實(shí)驗(yàn)交付、標(biāo)書(shū)寫(xiě)作、論文潤(rùn)色、協(xié)助投稿
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康旭禾生物提供包括動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、分子實(shí)驗(yàn)、病理實(shí)驗(yàn)、流式檢測(cè)實(shí)驗(yàn)及論文翻譯、潤(rùn)色、投稿輔助等相關(guān)的各項(xiàng)服務(wù)。
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