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qPCR擴增曲線與Ct值解讀

瀏覽:224 發(fā)表時間:2025-07-30

在熒光定量 PCR(qPCR)技術中,qPCR 擴增曲線與 Ct 值(或Cq值)是理解和分析實驗結果的核心要素。它們就像一把鑰匙,為我們解鎖基因表達量的秘密,在生命科學研究和臨床診斷等領域發(fā)揮著至關重要的作用。   


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  qPCR通過熒光染料或探針與擴增的雙鏈DNA結合,產生熒光信號。機器實時監(jiān)測熒光信號變化,反映DNA擴增的數(shù)量。通過分析熒光信號的強度,可以定量分析樣品中的目標基因。PCR指數(shù)擴增過程當中,產物量與循環(huán)數(shù)之間的關系是:擴增產物量f(x)=起始模板量S×(1+E)^循環(huán)個數(shù)n。


2、什么是擴增曲線



定義:擴增曲線是描述PCR動態(tài)進程的曲線,以循環(huán)數(shù)為橫坐標,以反應過程中實時熒光信號強度為縱坐標。擴增曲線可以分成四個時期:基線期,指數(shù)期,線性期,平臺期。


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擴增曲線常以線性圖譜和對數(shù)圖譜兩種形式展現(xiàn)。


線性圖譜:以 PCR 循環(huán)數(shù)為橫坐標,熒光信號強度為縱坐標,直接呈現(xiàn)熒光信號隨循環(huán)數(shù)增加的變化情況。


對數(shù)圖譜:以 PCR 循環(huán)數(shù)為橫坐標,熒光信號強度的對數(shù)為縱坐標,突出指數(shù)增長期的特征,此階段曲線會呈現(xiàn)為一條直線。  

   

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對數(shù)圖譜  

     

線性圖譜



2、什么是CT值(Cq值)


 定義: PCR擴增過程中,擴增產物的熒光信號達到設定的熒光閾值時的所對應的擴增循環(huán)數(shù)(Cycle Threshold)。C代表Cycle,T代表Threshold。


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閾值(threshold):在擴增曲線的指數(shù)增長區(qū)域內,選擇任意適當位置設定的熒光檢出界限。

熒光閾值一般由儀器自動設置,也可以手動設置。熒光域值閾值線的缺省設置通常是PCR擴增前3-15個循環(huán)的熒光信號標準偏差的10倍。

同一次反應中對于不同的基因可單獨設置閾值,但對于同一個基因擴增一定要設置相同的閾值。


3、為什么要有CT值
   3.1Ct值具有重現(xiàn)性:同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內擴增,得到的Ct值是恒定的。


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注:模板為10^5k拷貝GAPDH,用GAPDH引物擴增。96個孔重復結果的Ct平均值為19.1,變異系數(shù)(Cv)=0.002.   3.2Ct值與起始模板的線性關系:由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關系,可利用標準曲線對未知樣品進行定量測定。


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